广东省药学会前身为1945年成立的广州药师公会，1951年成为中国药学会广州分会。1958年在原有基础上扩大组织，成立中国药学会广东分会，负责组织全省药学科技工作者的相关活动。1985年起，中国药学会广东分会一直挂靠在广东省食品药品监督管理局（省医药管理局）。1991年，按民政部门文件要求更名为广东省药学会。

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